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Artigos Introdução à Programação para Bioinformática com Perl

Referências bibliográficas

Este conteúdo faz parte do livro “Introdução à Programação para Bioinformática com Perl“. Você pode adquirir a versão impressa desse livro aqui ou a versão para Kindle aqui. Para nos citar, consulte este link.

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Dwyer, Rex A. Genomic Perl – From Bioinformatics Basics to Working Code. Cambridge University Press. 2003.

Jargas, Aurelio Marinho. Expressões Regulares – Guia de Consulta Rápida. Novatec. 2001.

Jensen, Mark A. HOWTO:BlastPlus – BioPerl. Disponível em: <http://www.bioperl.org/wiki/HOWTO:BlastPlus>. Acesso em: 18 de janeiro, 2016.

Mariano, D. C. B.; Barroso, J. R.; Correia, T.; de Melo-Minardi, R. C. Introdução à programação para Bioinformática com Biopython. Primeira edição. North Charleston, SC (EUA): CreateSpace Independent Publishing Platform. 2015.

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Sebesta, Robert W. Conceitos de Linguagens de Programação. Bookman Editora, 2009.

Stajich J, Block D, Boulez K, Brenner S, Chervitz S, Dagdigian C, Fuellen G, Gilbert J, Korf I, Lapp H, Lehväslaiho H, Matsalla C, Mungall C, Osborne B, Pocock M, Schattner P, Senger M, Stein L, Stupka E, Wilkinson M, Birney E. (2002). The Bioperl Toolkit: Perl Modules for the Life SciencesGenome Res 12 (10) p. 1611–8. 

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Wall, Larry; Christiansen, Tom; Orwant, Jon. Programming Perl. Third Edition. O’Reilly Media. 1991.

Nota do autor
Prefácio

Capítulo 1
Introdução ao Perl

Capítulo 2
Comandos condicionais

Capítulo 3
Strings

Capítulo 4
Arrays

Capítulo 5
Laços de repetição

Capítulo 6
Manipulando arquivos

Capítulo 7
Sub-rotinas

Capítulo 8
“O guia de sobrevivência para expressões regulares em Perl”

Capítulo 9
Introdução ao BioPerl

Capítulo 10
Sequências

Capítulo 11
BLAST

Capítulo 12
Estruturas de proteínas

Capítulo 13
Hierarquia do BioPerl

Epílogo
Referências bibliográficas
Sobre os autores

Por favor, nos cite:

MARIANO, DIEGO CÉSAR BATISTA; de MELO-MINARDI, R. C. . Introdução à Programação para Bioinformática com Perl. 1. ed. North Charleston, SC (EUA): CreateSpace Independent Publishing Platform, 2016. v. 2. 200p .

Por Diego Mariano

Doutor em Bioinformática pela Universidade Federal de Minas Gerais com atuação na área de ciência de dados e aprendizado de máquina aplicados ao aperfeiçoamento de enzimas usadas na produção de biocombustíveis. Mestre em Bioinformática, também pela UFMG, atuando na área de desenvolvimento de sistemas Web para montagem de genomas. Atualmente realiza estágio pós-doutoral no Departamento de Ciência da Computação da UFMG com foco em desenvolvimento de sistemas Web para Bioinformática, análise exploratória e visualização de dados. Tem conhecimentos nas linguagens: PHP, JavaScript, Python, R, Perl, HTML, CSS e SQL.

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