Python for Bioinformatics (p4b)
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Categoria: Python
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Criando websites com CodeIgniter
Neste artigo, você irá aprender a criar um site usando CodeIgniter, um framework PHP. Segundo sua seus desenvolvedores, “CodeIgniter é um framework PHP poderoso com uma pegada muito pequena, desenvolvido para desenvolvedores que precisam de um kit de ferramentas simples e elegante para criar aplicativos da web completos”. Para este projeto, você precisará ter instalado…
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Como ler um arquivo mmCIF
usando Python
Este material faz parte do livro “Python para Bioinformática” (ainda não publicado). Para mais informações, consulte o autor. Expressões regulares são ferramentas poderosas para buscas de padrões em textos. Logo, todo o bioinformata deve conhecê-las. Neste artigo, você irá conhecer os principais metacaracteres e irá aprender a manipular expressões regulares usando Python. Bons estudos! Expressões…
Este material faz parte do livro “Python para Bioinformática” (ainda não publicado). Para mais informações, consulte o autor. Decomposição por valores singulares, do inglês Singular Value Decomposition (SVD) é uma técnica da álgebra linear usada para recuperação de informações, redução dimensional e remoção de ruídos. Nessa técnica, uma matriz A de tamanho MxN é decomposta…
Aqui faremos uma análise de contagem de palavras
Podemos ler os arquivos de um diretório usando o módulo os e a função listdir(). Observe como:
Function declaration JS
Neste tutorial, vou mostrar como podemos usar Python para baixar metadados de artigos da API do PubMed. Antes de mais nada, crie uma conta no My NCBI, vá nas configurações e crie uma chave de API. Isso permitirá que você faça até 10 requisições por segundo. Passo 1. Obtendo o PubMed-ID Se você tem o…
